当財団は、昭和20年7月1日、石川県、富山県及び福井県の出資により財団法人北陸血清製造所として建設される。
財団は、予防治療剤の製造、検査等をなし併せて予防医学に関する研究を行い広く国民衛生の改善進歩を図ることを目的としている。昭和48年7月1日、財団法人北陸血清研究所と改名し、血清検査事業を主として行ってきましたが、事業拡大に伴い、平成4年10月に財団法人北陸保健衛生研究所と名称を改め、保健、環境、衛生、食品、臨床に係る検査及び調査研究事業を行っている。